तथापि, धार्मिक मनाची उत्क्रांती नेमकी कोणत्या यंत्रणांनी घडवून आणली याबद्दल मतभेद आहेत. विचारांच्या दोन मुख्य शाळा आहेत: एकतर तो धर्म नैसर्गिक निवडीमुळे विकसित झाला आणि त्याला निवडक फायदा आहे . किंवा धर्म हा इतर मानसिक रूपांतरांचे उत्क्रांतीवादी उपउत्पादन आहे .